Основными функциями Центра медицинской профилактики являются организация и координация деятельности государственных учреждений здравоохранения Ямало-Ненецкого автономного округа по профилактике неинфекционных заболеваний и реализация комплекса мер, направленных на формирование здорового образа жизни населения. Сегодня Центр курирует работу 3 центров здоровья, 7 отделений и 8 кабинетов медицинской профилактики, функционирующих в медицинских организациях автономного округа.
Мероприятия, проводимые центром медицинской профилактики поддерживает Ямальский филиал СОГАЗ-Мед.Кроме того, страховые представители проводят консультациисотрудникам Центра.